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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

漳州台联会长：活化涉台文物 唤醒迁台共同记忆******

　　中新社漳州1月2日电 (记者 张金川)“在当前两岸关系背景下，我们不能让涉台历史静默、黯然，应该讲好漳台故事。”福建漳州市台湾同胞联谊会会长方丽云2日接受中新社记者采访时表示，应让涉台资源充分活化，唤醒台湾同胞特别是台湾青少年的根脉意识、祖地意识。

　　当天上午，漳州市政协十四届二次会议开幕，方丽云在大会书面发言中指出，漳州与台湾隔海相望，独特的地理位置决定了漳州与台湾无法割断的联系。“漳台的渊源关系渐渐以族谱、家书等文献和文物古迹的方式沉淀下来，是维系两岸同胞感情的重要纽带。”

　　方丽云称，当前，族谱、书信、老照片等“迁台记忆”的征集工作已在福建全省展开，漳州市涉台文物保护工作健康有序发展，取得较好成效。官方数据显示，该市现有涉台文物306处，重点涉台文物88处，为福建省之最。

　　但目前漳州市涉台文物研究水平较低，对涉台文物丰富的历史文化内涵的深入发掘、展示和传播不足；同时，反映海峡两岸历史渊源的文献资料和生产生活实物资料消逝速度加快，抢救和征集工作十分紧迫。对此，方丽云提出以下建议：

　　一是做好涉台文物保护利用的宣传、研究和规划编制。设立并启动“涉台文物保护工程”，重点保护一批祖籍在漳州的台湾同胞的祖祠、祖居和历史文化村镇。同时，有计划地深入挖掘和保护反映两岸渊源的文化、习俗、传统工艺、传统产业等非物质文化遗产。

　　二是以历史文化名城效应开辟涉台文物交流窗口，在历史文化名城保护过程中带动涉台文物古迹的开发利用。

　　三是有重点地利用历史文化资源举办专题性展览。进一步整合漳州市目前众多能反映两岸关系，尤其是漳台关系的专题博物馆等资源，积极探索更具时代性、趣味性、参与性的展示方式。

　　四是积极开展海峡两岸文化交流活动。充分利用文物史迹和历史名人优势，组织学术研究机构加强两岸交流互访，将学术研究与现实服务有机结合起来，促进漳台文化研究的深入和学术的繁荣。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）